Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2al1jA2BFR3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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