Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms