Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scn1aA2APX8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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