Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc183A2AJB1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms