Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms