Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbf1A2A870 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms