Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calcoco2A2A6M5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms