Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms