Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RNP2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RNP2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms