Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm5538W4VSP6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5538W4VSP6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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