Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms