Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms