Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt27Q9Z320 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Krt27Q9Z320 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Krt27Q9Z320 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Krt27Q9Z320 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms