Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf3Q9Z2L7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Crlf3Q9Z2L7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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