Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms