Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E3

Ern2, Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE2, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ern2Q9Z2E3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ern2Q9Z2E3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ern2Q9Z2E3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms