Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps6ka4Q9Z2B9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms