Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms