Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trip6Q9Z1Y4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms