Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ilf3Q9Z1X4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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