Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms