Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Cldn13Q9Z0S4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cldn13Q9Z0S4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn13Q9Z0S4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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