Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PapolbQ9WVP6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms