Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArcQ9WV31 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms