Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv2Q9WTR1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms