Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrkQ9R0G8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms