Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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BcamQ9R069 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms