Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Npas3Q9QZQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Npas3Q9QZQ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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