Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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