Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms