Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms