Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp3Q9QY23 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms