Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Kcnip3Q9QXT8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Kcnip3Q9QXT8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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