Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms