Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trp53inp1Q9QXE4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms