Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tcea2Q9QVN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tcea2Q9QVN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms