Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk3Q9QUN9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms