Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms