Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolkQ9QUG2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolkQ9QUG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms