Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tgm1Q9JLF6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms