Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms