Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scamp4Q9JKV5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms