Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms