Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ybx3Q9JKB3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms