Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms