Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpf2Q9JJ80 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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