Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LratQ9JI60 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms