Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms