Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcirg1Q9JHF5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms