Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp29Q9ES63 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp29Q9ES63 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp29Q9ES63 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms